咖啡含有豐富的抗氧化物質，可保護血管，抑制血管發炎，在咖啡因不過量的情況下，喝咖啡有很多好處。
每天300cc改善餐後血糖 美國研究團隊追蹤八萬人喝咖啡狀況，發現每天喝300cc咖啡的人，可降低糖尿病風險20%，去除咖啡因的咖啡一樣有效，其中木素可促進體內糖分利用，改善餐後血糖。 降低罹癌風險、防巴金森氏症 有研究認為，咖啡可降低罹患乳癌、巴金森氏症機率，也能降低血中尿酸，減少痛風發生。
不過，另有研究追蹤一百多名停經婦女，發現每天攝取咖啡因若超過300毫克，會降低大腿骨的骨質密度，導致骨質疏鬆。 緩解頭痛刺激腸道助排便 咖啡因成分和人體中傳遞疼痛訊息的化學物質相似，當攝取咖啡因時，它會取代這種化學物質的角色，使細胞接收不到疼痛訊號，減少疼痛感，同時有抑制血管擴張的作用，因此有人喝咖啡緩解頭痛。但對長期偏頭痛者，喝咖啡就沒有什麼效果，建議找專業醫師協助。
咖啡因也有刺激腸道蠕動功能，許多婦女習慣早上喝咖啡，期待能幫助排便、解決便秘。 咖啡減肥 有關分析認為，咖啡因對減輕體重有幫助的理由之一是利尿作用，理由之二則是燃燒脂肪的作用。
吃完食物後再攝取咖啡，咖啡因會促進胃部活動、分泌胃液，而胃液一旦分泌就可促進脾液的分泌，進而促使脂肪燃燒。
培養飯後喝咖啡的習慣，就可綜合咖啡的益處：利尿、基礎代謝亢進和促進胃液分泌作用，對於體重的減輕自然而然就有所幫助了，故以適量的咖啡保持體重穩定或減輕體重，即可達減肥效果! 顆粒粗細影響抗氧化效果 咖啡豆含有豐富抗氧化物，由於抗氧化物容易受氧氣及濕度影響，因此咖啡豆研磨越細，沖泡咖啡時，細顆粒與水的接觸面越多，就能釋放更多咖啡豆內的抗氧化物;反之，研磨不夠的粗顆粒咖啡豆，其抗氧化物就難釋放。
成份單純才算一杯好咖啡 “自己喜歡的咖啡就是好咖啡，因為喝咖啡是一種生活享受。”咖啡豆有很多品種，民眾能依自己的口味做選擇，喝咖啡前要細看成分，盡量選擇添加物少的咖啡，例如坊間三合一咖啡經常含奶精、高熱量的焦糖等，建議減少攝取，以免增加身體負擔。
咖啡現磨現喝，風味及營養最佳，若能自己沖泡咖啡，可以蜂蜜、代糖等取代砂糖，或以低脂牛奶取代奶精，添加量視自己口味決定。
咖啡一天不要喝超過600cc 研究發現，90%人喝完咖啡後，在咖啡因作用6小時內睡不著;另10%人咖啡飲用過量，身體對咖啡因的感受力變得不敏感，反而越喝越想睡，甚至出現腸胃痼疾。 空腹太刺激 咖啡是高鉀飲品，咖啡因也會刺激食道下端的括約肌，所以喝咖啡過量時，長久下來易造成胃食道逆流，也會增加胃酸分泌，進而產生胃黏膜受損、胃潰瘍等胃部疾病，盡量別空腹喝咖啡。
若要避免喝咖啡造成胃痛，建議在咖啡內添加低脂牛奶，或是搭配餅乾、蛋糕、三明治等食物吃，也就是避免空腹飲用。
若是腎臟病、胃潰瘍、十二指腸潰瘍、骨質疏鬆、焦慮症、甲狀腺機能亢進等患者，建議改變喝咖啡或茶的時間點，或是降低咖啡因攝取量。